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微生物資源中心或微生物菌種保藏中心必須按照現(xiàn)有的相關法律規(guī)章或指南制訂更高要求的實驗室制度，并加以嚴格實施。英國UKNCC遵循BBSRC的所有關于科學研究、實驗、人員管理等方面的法律規(guī)定，如《科研實踐聯(lián)合法典》。為了保障所有人的安全，相關的安全法規(guī)必須建立，英國健康危害性物質監(jiān)控條例規(guī)定實驗室生物安全的工作場所必須遵行下列要求：充分的危害性評估；齊全的的危害控制措施；詳盡的健康和安全信息；必要的基本技能培訓；規(guī)范安全核查記錄系統(tǒng)；按照健全而可操作的安全法規(guī)來制訂良好的工作操作規(guī)范[9]。美國疾病預防與控制中心，編寫出版的《微生物學和生物醫(yī)學實驗室生物安全手冊》（第四版），將實驗室的生物安全等級分為四級，與之相對應，該手冊制定了不同生物安全水平實驗室的硬件設施與安全管理規(guī)范
此外，管理者必須通曉下一些法律，如美國的《愛國者法案》中對擁有危險生物資源者進行了嚴格限定，對不容許獲得限定的生物材料的人員資格進行了限定[5]。2002年美國出臺的《公共健康安全和生物恐怖法》，要求加強對特殊危害性生物材料注冊、擁有轉移、追蹤、強制信息反饋等以及實驗室安全管理等相關內容。在此項法案的指導下，美國的特別制劑管理法對來自美國國內外或者途徑美國國內的微生物制劑和毒物進行了規(guī)定，包括注冊申請、安全性評估、安全計劃、緊急反映計劃、培訓、運輸、記錄保存、檢察、告示等。另外，為配合“農(nóng)業(yè)生物恐怖保護法”，美國農(nóng)業(yè)部正在建立單獨的規(guī)定、標準和規(guī)程，來管理那些對人類、動物、植物以及動植物產(chǎn)品造成損害的生物制劑和毒物的保存和運輸。英國在在《反恐怖、犯罪與安全法》中，加強了在研究實驗室病原微生物和毒素獲得的控制，擁有相關的生物材料的研究機構或大學必須向政府有關部門登記注冊[9]。
我國的生物安全管理已具備了初步的法律法規(guī)體系，1989年9月1日起實行的《中華人民共和國傳染病防治法》，2003年5月份衛(wèi)生部緊急出臺《傳染性非典型肺炎防治管理辦法》，國務院總理溫家寶簽署第424號國務院令，公布《病原微生物實驗室生物安全管理條例》。從病原微生物的分類和管理、實驗室的設立與管理、實驗室感染控制、監(jiān)督管理、法律責任等方面進行詳細規(guī)定。
微生物知識產(chǎn)權的保護主要通過專利法進行。《中華人民共和國專利法》第二十五條第四項規(guī)定動物和植物品種不授予專利權。由于微生物既不屬于動物也不屬于植物的范疇，因而微生物是可以授予專利的主題。但是未經(jīng)人類的任何技術處理而存在于自然界的微生物由于屬于科學發(fā)現(xiàn)，且不具有工業(yè)實用性，所以不授予專利權。只有當微生物經(jīng)過分離，并經(jīng)人工構建成為純培養(yǎng)物，并且具有特定的工業(yè)用途時，微生物本身才是可以授予專利的主題。在微生物領域中，有些發(fā)明由于它不能重現(xiàn)，因不具有工業(yè)實用性而不能授予專利權。例如對下列方法不授予專利權：一是由自然界篩選特定微生物的方法，這種類型的方法由于受客觀條件的限制且具有很大隨機性，因此在大多數(shù)情況下都是不能重現(xiàn)的；二是通過物理、化學方法進行人工誘變生產(chǎn)新微生物的方法，這種類型的方法主要依賴于微生物在誘變條件下所產(chǎn)生的隨機突變，這種突變實際上是DNA復制過程中的一個或幾個堿基的變化，然后從中篩選出具有某種特征的菌株。由于堿基變化是隨機的，因此即使清楚記載了誘變條件，也很難通過重復誘變條件而得到完全相同的結果。這種方法在絕大多數(shù)情況下不符合專利法第二十二條第四款的規(guī)定，除非申請人能夠給出足夠的證據(jù)證實在一定的誘變條件下經(jīng)過誘變必然得到具有所需特性的微生物，否則不能授予這種類型的方法專利權[10 11 12]。
微生物資源擁有國擁有資源的所有權，由于資源的使用或應用而產(chǎn)生的實際利益，資源擁有國應當考慮與資源索取國的相關機構或個人達成利益分配協(xié)議，以保障資源所有國的利益。同時，雙方應當就微生物資源的使用達成相關的協(xié)議，以保障資源的可持續(xù)利用，并根據(jù)資源采集國提出保護甚至恢復的相關要求實施保護，以避免資源的破壞或消失。此外，微生物菌種材料的轉移過程中，為了保證資源擁有者、研究利用者的利益，可以商談制定生物材料轉讓協(xié)議（ Material transfer agreement，MTA），該協(xié)議可以從使用范圍、責任申明、賠償、產(chǎn)權、定購、交付貨款、更換等各方面對雙方進行詳細的約束。如，ATCC已經(jīng)制定自己MTA，如果從ATCC購買生物材料，首先要簽署相關MTA。目前OECD的相關組織正在進行關于MTA的共性問題研究。
為了保證微生物資源的可持續(xù)利用，CBD公約的規(guī)定如下：“每一締約國應盡可能并酌情在國家決策過程中考慮到生物資源的保護和持續(xù)利用；采取有關利用生物資源的措施，以避免或盡量減少對生物多樣性的不利影響； 保護并鼓勵那些按照傳統(tǒng)文化慣例而且符合保護或持續(xù)利用要求的生物資源習慣使用方式； 在生物多樣性已減少的退化地區(qū)資助地方居民規(guī)劃和實施補救行動；鼓勵其政府當局和私營部門合作制定生物資源持續(xù)利用的方法。最好在遺傳資源原產(chǎn)國建立和維持移地保護及研究植物、動物和微生物的設施，采取措施以恢復和復原受威脅物種并在適當情況下將這些物種重新引進其自然生境中，進行合作，為以上所概括的移地保護措施以及在發(fā)展中國家建立和維持移地保護設施提供財政和其他援助，按照本公約有關條款從事保護生物多樣性、持續(xù)利用其組成部分以及公平合理分享由利用遺傳資源而產(chǎn)生的惠益”[1]。目前，即將實施的中國—歐盟生物多樣性（ECBP）的示范項目，將對中國西部的生物多樣性的保護及可持續(xù)利用產(chǎn)生深遠的影響。
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