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在低資源設(shè)置評(píng)估HIV病毒載量 | |||
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以下三個(gè)通用的方法是目前檢測(cè)和量化HIV RNA逆轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈反應(yīng)(RT-PCR),核酸序列的擴(kuò)增(NASBA)和支鏈的DNA(BDNA)的發(fā)展中經(jīng)濟(jì)體。每個(gè)方法都需要三個(gè)步驟:樣品制備和病毒核酸提取,擴(kuò)增的靶核酸序列,或從目標(biāo)病毒RNA的檢測(cè)信號(hào)產(chǎn)生,檢測(cè)和/或定量的擴(kuò)增產(chǎn)物。
RT-PCR使用反向轉(zhuǎn)錄酶轉(zhuǎn)換成互補(bǔ)DNA(cDNA)的,然后復(fù)制,從而可以檢測(cè)到病毒RNA。在該方法中,RT-PCR量化艾滋病毒的RNA,使病毒載量的測(cè)定。
NASBA法是一種等溫?cái)U(kuò)增方法,其中被放大的靶RNA一個(gè)三酶系統(tǒng),通過競(jìng)爭(zhēng)性共擴(kuò)增控制定量。這種方法不再需要為熱穩(wěn)定的酶和熱循環(huán)用于RT-PCR所使用的工具目前,以下四個(gè)市售的病毒載量測(cè)定的所有使用這些通用的方法之一:羅氏分子系統(tǒng),實(shí)時(shí)HIV-1由Abbott實(shí)驗(yàn)室,Versant的HIV-1 RNA 1.0試驗(yàn)(KPCR COBAS AmpliPrep和COBAS TaqMan探針2.0)西門子醫(yī)療診斷和生物梅里埃的NucliSENS EasyQ HIV-1 V2.0 4,6COBAS TaqMan探針HIV-1 COBAS TaqMan探針HIV-1檢測(cè)是在體外核酸
擴(kuò)增檢測(cè)HIV-1 RNA人血漿中科瓦斯AmpliPrep儀器的自動(dòng)化樣品處理和COBAS TaqMan探針分析儀或COBAS TaqMan探針48分析儀自動(dòng)化擴(kuò)增和檢測(cè)的定量分析。這是一個(gè)完全自動(dòng)化的,實(shí)時(shí)PCR系統(tǒng)目標(biāo)gag和LTR區(qū)的HIV基因組,這會(huì)導(dǎo)致在檢測(cè)下限。
的COBAS TaqMan探針HIV-1的檢測(cè)只需要若干技術(shù),具有很寬的動(dòng)態(tài)范圍,是完全自動(dòng)化的(包括樣品轉(zhuǎn)移),并進(jìn)行分析,只需要一個(gè)單間,但它也有一些缺點(diǎn)。為了執(zhí)行COBAS TaqMan探針HIV-1檢測(cè),都需要一些專門的實(shí)驗(yàn)室空間和設(shè)備,適中的技術(shù)支持是必不可少的。該設(shè)備也是昂貴的,通常是可望而不可及的任何發(fā)展中世界的設(shè)施,可提供空間和支持。
實(shí)時(shí)HIV-1。雅培實(shí)時(shí)HIV-1檢測(cè)采用實(shí)時(shí)熒光定量PCR,但不像TaqMan探針,它的目標(biāo)是POL艾滋病毒基因組的整合區(qū)域。HIV RNA定量是一個(gè)自動(dòng)化的過程使用m2000sp樣品制備和核酸提取,擴(kuò)增和檢測(cè)m2000rt 雅培實(shí)時(shí)檢測(cè)的6個(gè)
主要優(yōu)勢(shì)包括其高吞吐量,動(dòng)態(tài)范圍大,而事實(shí)上,它可以是一個(gè)完全自動(dòng)化的,在PCR過程中的封閉系統(tǒng)。此外,該設(shè)備可用于評(píng)估HIV以外的其他病原體。然而,作為的COBAS TaqMan探針的,這個(gè)系統(tǒng)需要專用設(shè)備和空間,良好的技術(shù)支持,并有相當(dāng)?shù)慕鹑谕顿Y。
Versant的HIV-1 RNA 1.0 Versant的HIV-1 RNA 1.0檢測(cè)(BDNA)是一個(gè)自動(dòng)化的檢測(cè),還針對(duì)HIV基因組的的聚合酶整合區(qū)域,再次使用的樣品準(zhǔn)備模塊和擴(kuò)增/檢測(cè)模塊。
Versant的實(shí)驗(yàn)也有高吞吐量和可以完全自動(dòng)化,降低了污染的風(fēng)險(xiǎn)較PCR。沒有特定的實(shí)驗(yàn)室或需要單獨(dú)提取區(qū)域,的設(shè)備,也可用于評(píng)估其它病原體。然而,Versant面向檢測(cè)的主要缺點(diǎn)包括需要熟練的技術(shù)人員,良好的技術(shù)支持和財(cái)力。的NucliSENS EasyQ。的NucliSENS EasyQ HIV-1 V2.0使用NASBA艾滋病毒的擴(kuò)增和定量目標(biāo)gag區(qū)RNA(見表一)。此法的夫婦NASBA利用分子信標(biāo)利用的NucliSENS EasyQ分析儀實(shí)時(shí)檢測(cè)。NucliSENS EasyQ檢測(cè)提供了高吞吐量的優(yōu)勢(shì),只有中等技能要求。它也是一個(gè)完全自動(dòng)化的,封閉的系統(tǒng)。但是,它需要專門的空間和設(shè)備,在高容量的實(shí)驗(yàn)室的污染是有風(fēng)險(xiǎn)的。技術(shù)支持是必需的,加入已經(jīng)用這個(gè)方法成本高。
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