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自動(dòng)顯微鏡載玻片病理分析 | |||
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個(gè)性化醫(yī)療的時(shí)代,也帶來(lái)了新的希望,更好的,更針對(duì)性的癌癥治療。它也策動(dòng)爆炸免疫學(xué)和DNA為基礎(chǔ)的染色技術(shù),創(chuàng)造了新的機(jī)遇和挑戰(zhàn)在病變區(qū)域。用于癌癥治療的分子測(cè)試的進(jìn)展伴隨化療和放療的來(lái)臨,可能有一個(gè)對(duì)生存率的影響一樣大。然而,隨著高科技,因?yàn)樗鼈兛赡苁?,這些測(cè)試的力量是有限的能力,具有豐富經(jīng)驗(yàn)的病理學(xué)家通過(guò)顯微鏡載玻片考試實(shí)現(xiàn)演繹的見(jiàn)解。
病理學(xué)家主要使用兩種染色方法在分子病理學(xué),免疫組織化學(xué)(IHC)和熒光原位雜交(FISH)。IHC是用來(lái)測(cè)量抗體蛋白的表達(dá)方式,通過(guò)化學(xué)污漬可見(jiàn)。這種技術(shù)歷來(lái)集中在細(xì)胞的細(xì)胞或組是否表示一個(gè)特定的蛋白質(zhì),通常表明已存在或不存在的污垢。新的測(cè)試所要求的蛋白表達(dá)水平的定量分析,通過(guò)染色強(qiáng)度和模式和位置??在每個(gè)單元格中的染色。魚,在另一方面,是一個(gè)工具,以確定在單元格中的特定序列的DNA的存在,位置和數(shù)量。它正迅速成為識(shí)別基因擴(kuò)增的首選方法。魚,熒光染色的DNA探針雜交的DNA序列,位于激發(fā)時(shí)產(chǎn)生的熒光燈。
病理IHC和FISH技術(shù)的改進(jìn),直到最近被匹配成像技術(shù)的進(jìn)步。但自動(dòng)化發(fā)展作出這方面,建立和維護(hù)的分析方法,其特征在于高的重復(fù)性和準(zhǔn)確性的挑戰(zhàn)。在分析顯微鏡載玻片本文討論的病理學(xué)家面臨的挑戰(zhàn),并認(rèn)為新發(fā)展,如何在自動(dòng)圖像分析,可以幫助克服這些困難,以及容納染色技術(shù)的進(jìn)一步進(jìn)步。
自動(dòng)化減輕人眼的病理學(xué)家必須面對(duì)三個(gè)主要方面的挑戰(zhàn),在各自的領(lǐng)域:生產(chǎn)力,準(zhǔn)確性和客觀性。實(shí)驗(yàn)室是越來(lái)越大的壓力下,以提高生產(chǎn)力,也就是說(shuō),完成更多的測(cè)試和處理更多的幻燈片。手動(dòng)應(yīng)對(duì)工作山資源,工作人員和財(cái)政上放置一個(gè)恒定的應(yīng)變。在不久的將來(lái),這個(gè)負(fù)擔(dān)可能會(huì)迅速惡化。
依賴于觀察在任何領(lǐng)域的科學(xué)性,準(zhǔn)確性是至關(guān)重要的。然而,它報(bào)道說(shuō),經(jīng)過(guò)長(zhǎng)時(shí)間的視覺(jué)研究,眼睛和具體錐疲勞可以顯著地影響一個(gè)人的能力,辨別顏色的變化,并找出不尋常的物體。最后,還有一個(gè)客觀的問(wèn)題。人眼的性質(zhì)是這樣的,每個(gè)人看到一個(gè)對(duì)象從別人看到一個(gè)相同的對(duì)象的方式略有不同。因此,在這方面的主體是與生俱來(lái)的。此外,色彩和色調(diào)可以出現(xiàn)改變?cè)O(shè)置或上下文到另一個(gè)??吹綄?duì)同一對(duì)象的不同特點(diǎn),一個(gè)單一的觀察員可能在不同的時(shí)間,不同的觀察者可能會(huì)報(bào)告。
自動(dòng)化可以提高病理學(xué)的實(shí)踐中,通過(guò)克服手動(dòng)顯微鏡的局限性。有些好處是立即明顯。數(shù)字分析不會(huì)受疲勞。計(jì)算機(jī)可以被編程以識(shí)別視覺(jué)模式準(zhǔn)確地,它們比人眼更好的檢測(cè)在著色和強(qiáng)度的微妙的變化。此外,電腦是一致的,公正的,客觀的分析觀察。一個(gè)典型的例子是特定的的錐疲勞,這是一種臨時(shí)色盲。當(dāng)它折磨疲憊的病理學(xué)家,它會(huì)導(dǎo)致該人暫時(shí)無(wú)法注冊(cè)的顏色范圍。自動(dòng)化儀器是不容易衰弱等。
事實(shí)上,圖像分析計(jì)算可以管理和處理大量的數(shù)據(jù),以驚人的速度,沒(méi)有患任何人為的限制。應(yīng)用成像公司(圣何塞),在20世紀(jì)90年代中期就開(kāi)始在這方面的工作。其目的是自動(dòng)化徒勞無(wú)益的病理解剖病理學(xué)家的眼球的能力相結(jié)合,與電源的數(shù)字圖像分析。計(jì)算機(jī)科學(xué)家,病理學(xué)家和成像工程師團(tuán)隊(duì)的努力已導(dǎo)致在Ariol自動(dòng)圖像分析系統(tǒng)(見(jiàn)圖1)。
Ariol提供了一個(gè)新的調(diào)查工具箱的病理學(xué)家。成像應(yīng)用設(shè)計(jì)系統(tǒng),以補(bǔ)充病理學(xué)家的經(jīng)驗(yàn)和培訓(xùn)提出客觀,一致的,高分辨率的標(biāo)本可以量化的結(jié)果的產(chǎn)生。該技術(shù)具有應(yīng)用在各種病理設(shè)置,包括制藥和生物技術(shù)實(shí)驗(yàn)室,癌癥研究機(jī)構(gòu),大學(xué)醫(yī)療中心和臨床病理實(shí)驗(yàn)室。有望受益的醫(yī)療保健專業(yè)人士,其工作依賴于病理資料。
吞吐量的限制一直顯微鏡幻燈片分析的一大瓶頸。管理日益發(fā)展的今天山幻燈片和測(cè)試,需要一個(gè)系統(tǒng),可以一次處理大量的幻燈片,并提供方便幻燈片處理和操作。,Ariol系統(tǒng)的滑動(dòng)裝載機(jī)可管理多達(dá)50張幻燈片,在強(qiáng)大的托盤,便于運(yùn)輸?shù)幕脽羝惋@微鏡階段(見(jiàn)圖2)?;脽羝梢宰詣?dòng)掃描,甚至無(wú)人值守過(guò)夜和托盤可以不斷加載和卸載,在時(shí)鐘的操作幾乎沒(méi)有任何系統(tǒng)停機(jī)時(shí)間。
圖像分析系統(tǒng)的設(shè)計(jì)也讀取幻燈片獨(dú)特的條形碼,并涉及到一組特定的程序分析滑動(dòng)所需的編碼信息。這種機(jī)制使系統(tǒng)來(lái)分析,在單次運(yùn)行中的一個(gè)以上的類型的幻燈片。條碼系統(tǒng)的數(shù)據(jù)庫(kù)為基礎(chǔ),樣品的歷史記錄和數(shù)據(jù)的寶庫(kù)的鑰匙。
而不是作為一個(gè)升降機(jī),只是通過(guò)系統(tǒng)推幻燈片,幻燈片裝載機(jī)記得幻燈片的階段,甚至搬遷階段本身是一個(gè)微妙和敏感的工具?;脽羝瑫?huì)自動(dòng)放在相同的位置在5微米。細(xì)致在載玻片上的樣品的顯微鏡檢查的基礎(chǔ)上的組織或細(xì)胞的病理調(diào)查。使用手工的方式,這個(gè)過(guò)程本質(zhì)上是費(fèi)時(shí)的,從一個(gè)訓(xùn)練有素的操作員需要勤奮的濃度。
的Ariol系統(tǒng)的目的是消除手動(dòng)滑動(dòng)掃描所進(jìn)行的組織或細(xì)胞懸浮液中的一幀一幀的圖像捕獲的負(fù)擔(dān)。這是通過(guò)一個(gè)高分辨率的裝置的電荷耦合器件(CCD)相機(jī)優(yōu)化的低光敏感成像在整個(gè)光譜帶,它與一個(gè)高性能的奧林巴斯直立BX-61顯微鏡(奧林巴斯美國(guó)公司紐約州Melville)。由此產(chǎn)生的圖像質(zhì)量非常高,他們?cè)谄聊簧巷@示為高清晰度1600?1200像素的顯示器變成系統(tǒng)的自動(dòng)評(píng)分的基礎(chǔ)。
顯卡使用系統(tǒng),保證高圖像質(zhì)量,可以解放員工從幾個(gè)小時(shí)盯著顯微鏡。然而,在這一領(lǐng)域的科學(xué)直接鏡檢的重要性是不會(huì)被遺忘。只需點(diǎn)擊鼠標(biāo),系統(tǒng)用戶可以記得幻燈片搬上舞臺(tái)近,眼觀看。
自動(dòng)圖像分析系統(tǒng)的目的,不應(yīng)該以除去或減少人的控制,而是根據(jù)需要與全手動(dòng)控制選項(xiàng)提供的效率和自動(dòng)化通過(guò)高。的Ariol配有其自己的完全可編程的操縱桿,鍵盤,鼠標(biāo)和接口,通過(guò)該一系列的操作者可以交互地使用的圖像。雙顯示操作允許現(xiàn)場(chǎng)并排比較,或可讓用戶同時(shí)運(yùn)行多個(gè)接口。
圖像分析和結(jié)果處理在病理學(xué)上,成像算法必然是任何系統(tǒng)的分析能力的核心。病理圖像分析的目的是專Ariol系統(tǒng)的成像算法。每個(gè)模塊的成像算法被開(kāi)發(fā)協(xié)議IHC或FISH技術(shù)的一個(gè)特定類型為了使系統(tǒng)靈活在它的成像能力,分析算法都支持由一個(gè)所謂的可訓(xùn)練的分類,使習(xí)慣于用戶系統(tǒng)的功能他或她個(gè)人的實(shí)驗(yàn)室技術(shù),以便它可以迅速適應(yīng)一天到一天的運(yùn)行變化和方法論。
進(jìn)一步證明了系統(tǒng)的靈活性,在世界各地的實(shí)驗(yàn)室在日常使用的各種應(yīng)用程序。細(xì)胞Microsight罕見(jiàn)的事件檢測(cè),膜IHC Hersight和ERsight PRsight核IHC模塊IVD使用。其他模塊,研究使用,而不是只診斷程序,被指定為IHC,細(xì)胞質(zhì)DNA倍體,免疫熒光,微血管密度,前哨淋巴結(jié)細(xì)胞FISH,組織魚,組織芯片(TMA)應(yīng)用。
圖像分析是一個(gè)資源密集型的過(guò)程。因此,該系統(tǒng)設(shè)有雙Xeon處理器的服務(wù)器級(jí)硬盤驅(qū)動(dòng)器和內(nèi)存,以及Windows XP Professional操作系統(tǒng),確保沒(méi)有積壓的快速分析。除了分析滑梯,自動(dòng)圖像分析系統(tǒng)應(yīng)配備的功能,提高病理實(shí)驗(yàn)室中進(jìn)行后期效率。因此,應(yīng)用成像了Ariol的報(bào)表生成,數(shù)據(jù)歸檔和聯(lián)網(wǎng)功能。
系統(tǒng)生成全彩電子報(bào)告,可以包括重要的細(xì)胞或組織的圖像分析,數(shù)值數(shù)據(jù)和成績(jī),診斷意見(jiàn),并簽名的空間。消除紙報(bào)告所需的時(shí)間承諾,此功能可確保數(shù)據(jù)通信的清晰度和一致性,報(bào)告,電子郵件和傳真準(zhǔn)備的結(jié)果。支持整齊,符合成本效益的歸檔,該系統(tǒng)提供一個(gè)完整的臨床數(shù)據(jù)管理服務(wù)器,TB的硬盤空間,10 GB的數(shù)字視頻隨機(jī)存取記憶光盤,當(dāng)然,郵編,甚至軟盤。
這個(gè)數(shù)字為高通量的操作技術(shù)的潛力得到充分發(fā)揮,通過(guò)系統(tǒng)聯(lián)網(wǎng)。的病理學(xué)家不必?cái)D在顯微鏡時(shí),他們能夠?qū)彶榈那闆r下,包括清晰,高品質(zhì)的圖像,從他們的辦公室桌面PC。除了經(jīng)營(yíng)作為一個(gè)單一的單機(jī)系統(tǒng),可以配置不同的地方,坐落在實(shí)驗(yàn)室或部門(參見(jiàn)圖3)的的多次復(fù)查電臺(tái)和筆記本電腦數(shù)據(jù)錄入站Ariol。審查站啟用的病理學(xué)家或?qū)嶒?yàn)室主任審查正在進(jìn)行的工作,審查和簽署的案件,并優(yōu)化系統(tǒng)的報(bào)告和歸檔數(shù)據(jù)。數(shù)據(jù)輸入站可以被定位到寄存器每個(gè)顯微鏡載片上,因?yàn)樗婕暗綄?shí)驗(yàn)室。
到現(xiàn)有的第三方實(shí)驗(yàn)室信息系統(tǒng),圖像和數(shù)據(jù)可以無(wú)縫集成所產(chǎn)生的Ariol系統(tǒng)的。這是通過(guò)系統(tǒng)的先進(jìn)性,采用平臺(tái)無(wú)關(guān)的,非特定于供應(yīng)商的XML技術(shù)的Web服務(wù)。
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